Madson Allan de Luna Aragão

Bioinformático, científico de datos en salud, analista de I+D y gerente de producto

Currículum en PDF (inglés)

01Perfil

Soy doctorando en Bioinformática en la Universidad Federal de Minas Gerais, donde trabajo con ingeniería de software, aprendizaje automático, ómicas, biología estructural y quimioinformática. La investigación aplica algoritmos de aprendizaje profundo, con énfasis en modelos generativos, para caracterizar y diseñar péptidos antimicrobianos inspirados en el sistema inmune de organismos diversos, con el objetivo de generar candidatos terapéuticos contra la resistencia antimicrobiana mediante métodos in silico escalables.

Soy Nextflow Ambassador, especialista en Ciencia de Datos y Analytics por la PUC-Rio y estudiante de MBA en Ingeniería de Software en la USP. Esa combinación cubre análisis de datos, flujos de trabajo reproducibles, aprendizaje automático, gobernanza de datos y arquitectura de software.

En la maestría en Genética y Biología Molecular por la UFPE desarrollé AMPidentifier, una herramienta automatizada basada en aprendizaje automático que identifica secuencias antimicrobianas en datos genómicos y proteómicos. Antes me gradué en Biomedicina por la UFPE, con énfasis en Bioinformática y Patología Clínica, con prácticas en hospital, en laboratorios de biología molecular y en centros de investigación.

02Experiencia

Investigador, doctorando

ago 2024 hasta el presente

Instituto de Ciencias Biológicas (ICB), Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG)

Doctorado en Bioinformática centrado en aprendizaje profundo, genómica y biología estructural, aplicados a la caracterización y al diseño de péptidos antimicrobianos. El trabajo incluye modelos computacionales de interacción con membranas y simulaciones de dinámica molecular para evaluar estabilidad y función de los péptidos.

Nextflow Ambassador

ene 2026 hasta el presente

Seqera

Seleccionado como embajador de Nextflow para difundir flujos de análisis de datos escalables y reproducibles en la comunidad científica. La función abarca buenas prácticas de orquestación de pipelines, participación en el ecosistema de código abierto y adopción de Nextflow en computación de alto rendimiento y en la nube.

Investigador, maestrando

jun 2022 a jul 2024

Departamento de Genética (dGEN), Universidad Federal de Pernambuco (UFPE)

Desarrollo de AMPidentifier, herramienta basada en aprendizaje automático para identificar péptidos antimicrobianos en secuencias genómicas, con análisis de grandes conjuntos de datos y búsqueda de nuevas moléculas y firmas moleculares.

Analista de investigación y desarrollo

oct 2020 a ago 2023

PickCells

Desarrollo de aplicaciones para soluciones de IoT que usan visión por computadora en el reconocimiento de patrones en imágenes de interés clínico, con prototipado, desarrollo y validación de sistemas.

Becario de iniciación científica

ene 2020 a may 2022

Laboratorio de Genética y Biotecnología Vegetal (LGBV), Universidad Federal de Pernambuco (UFPE)

Investigación en bioinformática orientada a la caracterización y optimización de péptidos antimicrobianos bioinspirados, además del estudio de secuencias de eIF4E en especies de Vigna y su papel en la defensa vegetal frente a patógenos.

Practicante en patología clínica

oct 2021 a mar 2022

Empresa Brasileña de Servicios Hospitalarios (EBSERH), Hospital de Clínicas de la UFPE

Actividades en el Laboratorio de Análisis Clínicos del HC/UFPE: triaje de muestras, hematología, bioquímica, urianálisis, microbiología, determinaciones hormonales y serología.

Practicante de investigación, desarrollo tecnológico e innovación

abr 2020 a ago 2020

PickCells

Desarrollo de soluciones para el diagnóstico molecular de SARS-CoV-2.

Becario de iniciación científica

nov 2016 a dic 2019

Fundación Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)

Actividades en biología estructural y química teórica y computacional, con énfasis en modelado molecular e ingeniería de proteínas para diagnóstico y vacunas, en el Departamento de Virología y Terapia Experimental.

Becario de iniciación científica

may 2015 a dic 2016

Instituto Keizo Asami (iLIKA)

Actividades en el sector de biología molecular en genética humana y bioinformática, con énfasis en genética forense, marcadores de ancestralidad y predicción de fenotipo.

03Formación

Doctorado en Bioinformática, en curso

Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG), Belo Horizonte, Brasil

MBA en Ingeniería de Software, en curso

Universidad de São Paulo (USP), São Paulo, Brasil

Especialización en Ciencia de Datos y Analytics, 2026

Pontificia Universidad Católica de Río de Janeiro (PUC-Rio), Río de Janeiro, Brasil

Maestría en Genética y Biología Molecular, énfasis en Bioinformática, 2024

Universidad Federal de Pernambuco (UFPE), Recife, Brasil

Licenciatura en Biomedicina, énfasis en Patología Clínica y Bioinformática, 2022

Universidad Federal de Pernambuco (UFPE), Recife, Brasil

04Certificaciones

Generative AI2025

Massachusetts Institute of Technology (MIT), Professional Education

Agile Project Management Professional Certificate2025

Atlassian

Career Essentials in Project Management2025

Microsoft

Data-Driven Product Management2025

NASBA

Microsoft Azure AI Essentials: Workloads and Machine Learning2025

Microsoft

Requirements Engineering and Agile Product Management2025

PUC-Rio

The Data Science of Healthcare, Medicine, and Public Health2025

LinkedIn Learning

Advanced Gemini for Developers2024

Google DeepMind

Career Essentials in GitHub Professional Certificate2024

GitHub

Project Management2024

Project Management Institute (PMI)

Python Programming from Basic to Advanced2022

Udemy

Bioinformatics with Python2022

Udemy

05Publicaciones

The Regulatory Army of Plant Defense: Transcription Factors in the War for Plant Immunity

International Journal of Molecular Sciences · 10.3390/ijms27167315

Unveiling Three Functionally Diverse Isoforms of eIF4E in Cowpea Through a Multi-Omics Approach

Agronomy · 10.3390/agronomy16070766

Transposable elements: Functional aspects and applications as drivers of crop innovation

Crop Science · 10.1002/csc2.70257

Deciphering Cowpea Resistance to Potyvirus: Assessment of eIF4E Gene Mutations and Their Impact on the eIF4E-VPg Protein Interaction

Viruses · 10.3390/v17081050

Omics-driven bioinformatics for plant lectins discovery and functional annotation

International Journal of Biological Macromolecules · 10.1016/j.ijbiomac.2024.135511

Association strength of E6 to E6AP/p53 complex correlates with HPV-mediated oncogenesis risk

Biopolymers · 10.1002/bip.23524

Approaches for Identification and Validation of Antimicrobial Compounds of Plant Origin

Eco-Friendly Biobased Products Used in Microbial Diseases, CRC Press · 10.1201/9781003243700

Títulos y revistas se mantienen en el idioma original de publicación.

06Premios y distinciones

Next Generation Bioinformatician (NGB), X-Meeting 2025
Travel Grant Award, School on Biological Physics and Biomolecular Simulations in the Machine Learning Era, ICTP-SAIFR
Travel Grant Award, AI for Protein Design (AI4PD), The Protein Society
Young Geneticist Award of the Northeast, XXI ENGNE
Honorable Mention, Human and Forensic Genetics, CNPq/UFPE
Honorable Mention, Postgraduate Genetics Journey, UFPE
Best Poster Award, XIII Journey of the Genetics and Molecular Biology Program
Certificate of Excellence in the Peer Reviewing, Elsevier
Highest Admission Score, MSc in Genetics and Molecular Biology, UFPE
Highest Admission Score, PhD in Bioinformatics, UFMG

Premios en el idioma original de concesión.

07Docencia

Molecular Docking & Dynamics: Breathing Motion into Life's Building Blocks, 2nd Edition2025
Molecular Modeling with Machine Learning Techniques, 2nd Edition2025
Molecular Docking & Dynamics: Breathing Motion into Life's Building Blocks, 1st Edition2025
Molecular Modeling with Machine Learning Techniques, 1st Edition2025
Bioinformatics: A Theoretical-Practical Approach2024
Introduction to Bioinformatics, From DNA to Proteins: Databases, Annotation and Protein Modeling Techniques2022
Human Genetics, Federal University of Pernambuco2017-2018
Molecular Tools Applied to Clinical Diagnosis, Federal University of Pernambuco2017-2018

22 presentaciones en congresos, conferencias y simposios. Lista completa en el portafolio.

08Competencias

Bioinformática

Genómica y transcriptómica, Ensamblaje de genomas, Minería y anotación genómica, Biología molecular y estructural, Modelado de proteínas y membranas, Diseño de proteínas, Simulaciones de dinámica molecular, Desarrollo de pipelines

IA, datos y programación

Aprendizaje automático, Análisis y visualización de datos, Ingeniería y gobernanza de datos, Git y control de versiones, Python, Bash y Java, MySQL y PostgreSQL, Sistemas Linux y Unix, Docker y contenedores, Snakemake y Nextflow, Gestión de cargas en HPC

Producto y proyectos

Ciclo de vida de producto, Métodos ágiles (Scrum, Kanban), Diseño centrado en el usuario, Construcción de roadmap, Indicadores de desempeño (KPIs), Investigación de mercado y de usuario, Lean product development, Design thinking

Herramientas y plataformas

Figma, Miro, Jira, Trello y Azure, Prototipado y wireframes, Mapeo de recorrido del usuario, Control de versiones y gestión de releases, Google Workspace y Notion, Tableau y Power BI

Colaboración y comunicación

Liderazgo de equipos multidisciplinarios, Gestión de stakeholders, Comunicación técnica y de negocio, Resolución de problemas complejos, Narrativa con datos

09Contacto

LinkedInmadsonaragao
Google ScholarGmHvOYsAAAAJ
ResearchGateMadson-Aragao
AMPidentifierampidentifier.com

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