Mesmo prefixo, outro modelo.
Três pares que se confundem na conversa, linha a linha. A leitura embaixo de cada tabela diz no que a diferença dá, depois que a ficha técnica sai da frente.
ESM-2, ESM3 e ESM C
Três modelos com o mesmo prefixo que respondem perguntas diferentes.| ESM-2 | ESM3 | ESM C | |
|---|---|---|---|
| O que é | Codificador mascarado de sequência | Modelo generativo multimodal | Codificador mascarado de sequência |
| Trilhas | Sequência | Sequência, estrutura, função | Sequência |
| Gera | Logits de token mascarado | Sequência, estrutura e anotação | Logits de token mascarado |
| Tamanhos abertos | 8M a 15B | Checkpoint aberto de 1,4B | 300M, 600M, 6B |
| Contexto | 1024 tokens | Ver cartão do modelo | 2048 tokens |
| Use para | Embeddings e linhas de base | Design por prompt | Embeddings em escala maior |
| Publicado como | Science 2023 | Science 2025 | Preprint 2026 |
O ESM3 é a linha generativa e o ESM C a linha de representação. O ESM-2 segue como o ponto de referência contra o qual os dois são medidos, e ainda é o checkpoint que a maior parte do código adiante carrega.
AlphaFold 2 e AlphaFold 3
O que mudou de fato entre os dois.| AlphaFold 2 | AlphaFold 3 | |
|---|---|---|
| Tronco | Evoformer, fluxos de MSA e de pares | Pairformer, só token e pares |
| Alinhamento | Carregado pelo tronco inteiro | Resumido cedo e posto de lado |
| Decodificador | Módulo de estrutura, referenciais de resíduo | Difusão sobre átomos |
| Saída | Uma estrutura com confiança | Estruturas amostradas e ordenadas |
| Cobre | Proteínas, e multímeros por extensão | Proteínas, ácidos nucleicos, ligantes, íons |
| Atualizações em triângulo | Sim | Sim |
| Publicado como | Nature 2021 | Nature 2024 |
A maquinaria do triângulo sobreviveu e o fluxo do alinhamento não. Leia a diferença como a passagem de uma resposta determinística sobre proteínas para uma resposta amostrada sobre complexos biomoleculares.
ESMFold e ESMFold2
A mesma ideia, refeita sobre um codificador novo e outro decodificador.| ESMFold | ESMFold2 | |
|---|---|---|
| Codificador | ESM-2, congelado | ESM C |
| Alinhamento | Nenhum na consulta | Opcional, para alvos difíceis |
| Decodificador | Módulo de estrutura estilo AlphaFold 2 | Difusão de todos os átomos |
| Alcance | Cadeias únicas | Cadeias e complexos |
| Uso em design | Só predição | Inversão usada para desenhar ligantes |
| Situação | Science 2023 | Preprint 2026, sem revisão por pares |
A linhagem é um modelo de linguagem alimentando um decodificador de enovelamento. O que mudou é que o decodificador virou generativo e o alinhamento voltou como opção, não como exigência.