Posição
Sustentou os 41 sítios ativos do seu benchmark, contra 16 dos métodos anteriores. Enzimas ativas foram identificadas para três mecanismos catalíticos depois de testar menos de 96 sequências em cada caso.
Geração de esqueleto · Baker lab · 2025
RFdiffusion2
Desenha suportes diretamente a partir da geometria dos grupos funcionais catalíticos, sem especificar quais posições da sequência esses resíduos ocupam e sem geração de rotâmeros inversos.
Em linguagem simples
Design de enzima que parte da geometria da química. Você descreve onde os átomos catalíticos precisam ficar, e o modelo encontra uma proteína que os coloque ali, escolhendo sozinho a numeração dos resíduos.
Uma forma de imaginar
Em vez de dizer "o resíduo 45 tem de ser uma histidina", você diz "um nitrogênio de histidina precisa ficar aqui, neste ângulo". O modelo decide onde na cadeia isso cai.
O engano mais comum
Ativo numa triagem de menos de 96 designs é um resultado forte para design, e ainda muito longe de uma enzima que você usaria na indústria.
Distinções
- Motivos atômicos sem índice deixam o modelo escolher onde na cadeia cai um resíduo catalítico.
- A especificação é uma geometria de estado de transição, e não uma lista de resíduos.
- Mira design de enzimas em particular, onde métodos anteriores de suporte falhavam na maioria das vezes.
Limites
Atividade catalítica numa triagem de menos de 96 designs é um resultado forte para design, e ainda longe de uma enzima otimizada. Os números de renovação relatados vêm de estudos de caso individuais.
Pesos e código
Conferido no registro, não de memória| Repositório | Tamanho | Licença | Observação |
|---|---|---|---|
| RosettaCommons/RFdiffusion2 | See repository | See repository | — |